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DNA測序
DNA測序模仿了在染色體復(fù)制過程中復(fù)制細胞DNA的基本過程,只是該過程是在試管或微量滴定板中使用最少的一組組分完成的。
大多數(shù)DNA測序技術(shù)都要求有一個“模板”(即要確定其序列的DNA的生物學(xué)樣品)。
“引物”(即與模板區(qū)域互補并能夠延伸的短寡核苷酸);
DNA聚合酶,按照模板鏈的指示,在引物上依次添加結(jié)構(gòu)單元。
和四個構(gòu)建基塊本身。
該技術(shù)還必須體現(xiàn)一種方法,通過該方法可以檢測添加到底漆中的結(jié)構(gòu)單元的順序。
使用選擇的檢測方法,
大多數(shù)大型DNA測序設(shè)備都使用熒光染料標記和檢測四個堿基,并根據(jù)大小通過毛細管電泳分離DNA分子,從而可以識別序列中每個位置的堿基。
更具體地說,對于添加到測序反應(yīng)中的每個結(jié)構(gòu)單元的分子中的一小部分,該結(jié)構(gòu)單元經(jīng)過化學(xué)修飾并用可區(qū)分的染料標記,這樣,當將修飾的結(jié)構(gòu)單元隨機添加到從引物,復(fù)制“終止”,結(jié)果測序反應(yīng)包含大小不同的分子的混合物。
由于每個終止分子的末端均包含染料標記的堿基,因此可以確定與模板互補的鏈的序列。
上圖顯示了一組測序通道,其中電泳用于分離相差一個堿基的分子。
激光檢測用于識別每個位置的堿基。
使用“ A”為綠色,“ C”為藍色,“ G”為黃色,“ T”為紅色的鍵從下至上“讀取”序列。
使用測序儀制造商提供的軟件,可以確定每個位置的染料信噪比,從而可以“調(diào)用”適當?shù)膲A基。
堿基順序顯示在“色譜圖”或“跡線”文件中。
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