電泳在具有靜態pH的緩沖溶液中進行。電場施加到包含正端和負端的電泳室。如果被電泳物質的pH值低于周圍緩沖液，則會向正極遷移。如果該物質的pH值高于周圍的緩沖液，則會向負極遷移。物質以兩種不同的速率遷移：粒徑和總體電荷。遷移物質的pH值與周圍緩沖液的pH值之間的差異越大，物質越能通過凝膠遷移。大分子由于摩擦力而“卡住”，并且遷移速度小于可以通過凝膠導電并且阻力很小的較小顆粒。