一、 目的
建立SDS-PAGE電泳的測(cè)定方法,確保電泳檢測(cè)的準(zhǔn)確性,保證電泳的安全性、有效性。
二、 范圍與權(quán)責(zé)
適用于本公司的所有成品以及中間體的分析,由化驗(yàn)員負(fù)責(zé)采樣檢測(cè)。 品控主管負(fù)責(zé)審核。
三、 原理
SDS-PAGE電泳,是在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中引進(jìn)SDS,SDS會(huì)與變性的多肽結(jié)合,并使蛋白帶負(fù)電荷,由于多肽結(jié)合SDS的量總是與多肽的分子量成正比而與其序列無(wú)關(guān),因此SDS多肽復(fù)合物在丙烯酰胺凝膠電泳中的遷移率只與多肽的大小有關(guān),在達(dá)到飽和的狀態(tài)下,每克多肽可與1.4g去污劑結(jié)合。當(dāng)分子量在15KD到200KD之間時(shí),蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對(duì)數(shù)呈線性關(guān)系,符合下式:lgMw=k-bX。式中:Mw為分子量;X為遷移率;k、b均為常數(shù),若將已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)的遷移率對(duì)數(shù)分子量對(duì)數(shù)作圖,可獲得一條標(biāo)準(zhǔn)曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進(jìn)行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標(biāo)準(zhǔn)曲線上求得分子量。
四、 實(shí)驗(yàn)儀器及試劑
1. DYCZ-24DN 雙垂直
電泳儀 2. DYY-8C
電泳儀電源
3. STS-2A
脫色搖床(水平) 4. 標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker 5. 平皿:直徑150mm 6. TEMED:四甲基乙二胺 7. DTT:二硫蘇糖醇 8.
儲(chǔ)存液
①2M Tris-HCl緩沖液:稱(chēng)取24.2g Tris,用50ml蒸餾水溶解后,滴加HCl調(diào)節(jié)pH**8.8,待室溫,加蒸餾水**100ml。
②1 M Tris-HCl緩沖液:稱(chēng)取12.1g Tris,用50ml蒸餾水溶解后,滴加HCl調(diào)節(jié)pH**6.8,待室溫,加蒸餾水**100ml。
③10%SDS溶液:稱(chēng)取10g SDS ,加蒸餾水溶解**100ml。 ④50%甘油:50ml甘油加50ml蒸餾水,混合均勻。
⑤1%溴酚藍(lán):100mg溴酚藍(lán),加蒸餾水**10ml,攪拌**完全溶解,水相針式過(guò)濾器過(guò)濾除去聚合的染料。 9. 工作液
①A液:30%丙烯酰胺儲(chǔ)存液,丙烯酰胺是一種神經(jīng)毒素,可通過(guò)皮膚被人體吸收并富集。操作時(shí)要避免皮膚接觸,并帶合適的口罩于通風(fēng)櫥中進(jìn)行。
②B液—分離膠緩沖液:取75ml 2M Tris-HCl緩沖液,4ml10%SDS溶液,加21ml蒸餾水,混合均勻,4℃保存數(shù)月。
③C液—濃縮膠緩沖液:取50ml 1M Tris-HCl緩沖液,4ml10%SDS溶液,,加46ml蒸餾水,混合均勻,4℃保存數(shù)月。
④10%APS:稱(chēng)取1g過(guò)硫酸銨,加10ml蒸餾水溶解后,水相針式過(guò)濾器過(guò)濾分裝到EP管中,4℃保存一個(gè)月,-20攝氏度保存一年。 ⑤上樣緩沖液:稱(chēng)取0.154g DTT,于10ml容量瓶中,加少量水溶解后,加 0.6ml 1 M Tris-HCl緩沖液,5ml 50%的甘油,1ml 1%溴酚藍(lán),混合均勻后定容**刻度線。
可分裝**EP管保存,4℃保存一個(gè)月,-20攝氏度保存一年。
⑥電極緩沖液:稱(chēng)取3g Tris,14.4g Gly,1g SDS**1L燒杯中,加1L蒸餾水溶解,攪拌均勻,室溫保存。
10. 染色液:稱(chēng)取1g考馬斯亮藍(lán)R-250,加450ml乙醇,加100ml乙酸,加水450ml,混合均勻,室溫保存。
11. 脫色液:100ml乙醇,加100ml冰醋酸,加水800ml,混合均勻,室溫保存。
五、 操作步驟
①將平板玻璃和凹板玻璃重疊,用手將兩塊玻璃板在桌面上或是玻璃板上豎起,使兩玻璃底面平齊,從而形成膠室。
②將膠室放入主體,是凹玻璃的一面向內(nèi)。若做單面膠,另一側(cè)用單膠堵板(δ=5mm)代替。 ③插入楔形插板,用力向下按,擠緊玻璃板。
④將主體放入原位制膠器內(nèi),手柄起立位與底座箭頭對(duì)齊,兩手同時(shí)把手柄向主體推動(dòng),直到推不動(dòng)為止,然后開(kāi)始旋轉(zhuǎn)手柄,聽(tīng)到咔、咔兩聲,底座箭頭指向手柄1.0mm標(biāo)志處,此時(shí)楔形插板已壓緊膠室,可以開(kāi)始灌膠了。 2、分離膠的配制
按上表,將A液,C液,蒸餾水先加到小燒杯中,混合均勻,再添加10%APS,TEMED后,混合均勻,迅速連續(xù)灌到分離膠頂部,直**有膠溢出,隨即插入試樣格,在室溫或恒溫箱內(nèi)垂直放置10min,靜置直**完全聚合。 4、樣品的處理
將樣品與上樣緩沖液以4:1混合均勻,在金屬浴上100℃,10min,如有沉淀,可適當(dāng)離心備用。 5、加樣
①在凝膠聚合后,向相反的方向擰手柄,手柄彈出。 ②將電泳儀主體從原位制膠器上取出放入電泳儀下槽中。
③將約140ml的電泳緩沖液倒入由膠室和主體形成的上槽中,使緩沖液沒(méi)過(guò)凹玻璃板。
④將約200ml的電泳緩沖液倒入下槽中 ⑤慢慢地將試樣格垂直拔出。
⑥將處理好的標(biāo)準(zhǔn)蛋白和待測(cè)蛋白樣品,按預(yù)定順序通過(guò)緩沖液小心的添加5~10μl到每個(gè)樣品孔中。 6、電泳
蓋好
電泳槽蓋,接通電泳儀電源與電泳儀之間的電泳導(dǎo)線,設(shè)定電壓為60V,電泳時(shí)間約為30min,直**溴酚藍(lán)指示帶經(jīng)過(guò)濃縮膠與分離膠的分界線后,設(shè)定電壓100v,電泳時(shí)間150min,直**溴酚藍(lán)指示帶接近分離膠底部,切斷電源,電泳完畢。 7、剝膠
卸下電泳膠板,用刮刀小心撬開(kāi)玻璃板,使兩者分離,切除凝膠左下角以示標(biāo)記。 #p#分頁(yè)標(biāo)題#e#
8、染色
從玻璃板上,將凝膠小心的整塊刮到裝有染色液的平皿中,置于搖床上染色45r/min,1h。 9、脫色
從染色液中小心取出凝膠,注意不要弄破,用蒸餾水清洗幾次,轉(zhuǎn)移到裝有脫色液的平皿中,置于搖床上脫色45r/min,根據(jù)脫色情況更換脫色液,脫色過(guò)夜。 脫色后,可將凝膠拍照保存,或是將凝膠浸于水中保存一段時(shí)間。
10、繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線
測(cè)量染料和蛋白質(zhì)區(qū)帶移動(dòng)的距離,即從分離膠電泳起始**染料區(qū)帶孔洞及蛋白質(zhì)區(qū)帶中心位
置的距離。
11、標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
縱軸為標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)相對(duì)分子質(zhì)量的對(duì)數(shù),橫軸為對(duì)應(yīng)的遷移率,可得標(biāo)準(zhǔn)工作曲線,即可根據(jù)
遷移率測(cè)出未知蛋白的分子量。
六、 問(wèn)題分析與解決辦法
1、“微笑”(兩邊翹起中間凹下)形帶原因?
主要是凝膠中部凝固不均勻?qū)е拢嘁?jiàn)于比較后的凝膠中。可以使其充分混合均勻后制膠,待其凝固完全后,再做后續(xù)實(shí)驗(yàn)。 2、拖尾、紋理現(xiàn)象的產(chǎn)生?
只要是樣品的溶解效果不好,有顆粒存在,可以加樣前離心一下;電泳緩沖液時(shí)間過(guò)長(zhǎng),重新配制。