在早期,鄙人亦依據(jù)分子克隆的介紹,采用立春紅染膜。只是后來發(fā)現(xiàn)此操作不僅增加額外的操作時間,而且不能說明任何問題,于是拋棄之。首先,立春紅(也包括考染膠)的靈敏
度和HRP-ECL體系的靈敏度相差太遠,即使立春紅染膜無顏色,也無法提示W(wǎng)B結(jié)果會不會失敗(考染膠無顏色也不能說明轉(zhuǎn)膜充分了,除非你銀染),你仍然得繼續(xù)后面的操作;相反靶蛋白區(qū)域有顏色,亦無法提示靶蛋白就轉(zhuǎn)膜完全了,也許只是另外一個分子量大小相近的蛋白。因此,無論立春紅染膜失敗或成功,你都必須進行后續(xù)的操作。而立春紅染膠不僅增加額外的操作時間,而且增加一輪漂洗的操作,對膜和膜上的蛋白都不好。那么為什么不采用更直觀的預(yù)染marker做轉(zhuǎn)膜監(jiān)控的依據(jù)呢?理論上,同時轉(zhuǎn)膜、顏色是交聯(lián)到蛋白上的,因此顏色有多深表明有多少蛋白轉(zhuǎn)印到膜上,非常直觀、不會增加任何額外的操作(固定marker的上樣量非常必要)。當然上面提到針對PVDF膜,由于對小分子截留的局限,顏料分子會在高強度的轉(zhuǎn)印過程中從交聯(lián)的蛋白上脫落并穿過膜(顏料與蛋白交聯(lián)得過深會使整個lane糊掉;太緊(多)可改變蛋白構(gòu)象使遷移率改變。所以多數(shù)情況下顏料和蛋白之間是一種不穩(wěn)定的交聯(lián),這意味著在某些條件下,顏料會從交聯(lián)的蛋白上脫落,又因為膜分子孔徑以及膜對不同物質(zhì)吸附能力的差異,顏料小分子會輕易穿過膜到濾紙背面,而蛋白則被牢固的截留在膜上),造成轉(zhuǎn)膜過度的假象。現(xiàn)在你知道有這種局限,要么更換NC膜;要么采用上面提到的非常穩(wěn)定的轉(zhuǎn)膜條件、注意必要的細節(jié),就可從根本上忽略掉其對轉(zhuǎn)膜效率的指示,而把預(yù)染的marker僅僅作為一個分子量大小的指針,當然同時可確認之前的轉(zhuǎn)膜操作無誤(沒有插反電極,放反膜),也可為后續(xù)抗體孵育操作時膜的正反面做必要的提示。
不同公司預(yù)染的marker效果不太相同,一般NEB和invitrogen的常規(guī)分子量預(yù)染marker要上8-10ul,MBI的只要5ul(膠大小20×30cm),Biorad-mini3型(8.2×7.4cm)MBI**低2.5ul轉(zhuǎn)膜后就足夠清晰。